В 1989 году с отличием окончила Государственную финансовую академию по специальности «международные экономические отношения».
С октября 2009 года Надежда Ушакова является начальником депозитария банка ВТБ.
До прихода в банк ВТБ Надежда Ушакова возглавляла депозитарий «Дойче банка».
С 1997 по 2004 год занимала пост заместителя начальника депозитария ИНГ банка (Евразия).
С 1995 по 1997 год работала в отделе ценных бумаг Российско-американского инвестиционного банка.