Райнер Линднер получил в 1997 году степень кандидата наук в университете Тюбингена, в 2005 году – степень доктора наук в университете Констанца.
С 2008 года Райнер Линднер занимает должность директора Восточного комитета германской экономики и доцента в университете Констанца.
Ранее он являлся советником по зарубежной политике в федеральном правительстве и в Бундестаге, будучи сотрудником немецкого фонда «Наука и политика».
Райнер Линднер также является соредактором периодического издания Osteuropa: Zeitschrift für Gegenwartsfragen des Ostens («Восточная Европа: журнал об актуальных вопросах Восточной Европы»), членом правления Немецкого общества по изучению стран Восточной Европы, членом Берлинского института населения и развития, а также председателем Немецко-белорусского общества, членом-учредителем Германо-украинского форума и председателем Минского форума.