С 1985 по 1990 – Академия федеральной службы безопасности РФ, квалификация — инженер электросвязи. С 1999 по 2001 – Московский государственный институт радиотехники, электроники и автоматики, квалификация экономиста по специальности финансы и кредит. С 2006 по настоящее время Дмитрий Годунов получает степень MBA (Деловое администрирование) в Бизнес-школе Ворвик (Великобритания).
Проработав некоторое время в ЗАО ФТК «Время» и «Верофарм» на руководящих позициях, Дмитрий Игоревич оказался в ЗАО «УК Аптечная сеть 36,6», где с июня 2004 по сентябрь 2006 он проработал в должности директора по операциям, а с сентября 2006 и по сей день Дмитрий Игоревич пребывает в должности первого заместителя генерального директора ЗАО «УК Аптечная сеть 36,6».
«Аптечная сеть 36,6», основанная в 1998 году, – первая публичная компания на российском фармацевтическом рынке. Сегодня она является национальным лидером в области розничной торговли товарами для красоты и здоровья. «Аптечная сеть 36,6» насчитывает сегодня 1168 аптек в 29 регионах России. В компании работает более 11000 высококвалифицированных сотрудников и сильная менеджерская команда с опытом работы в отрасли более 10 лет. «Аптечная сеть 36,6» имеет свое производственное подразделение – ОАО «Верофарм», а также владеет сетью детских магазинов развивающих игрушек – ELC (Центр раннего развития). ЗАО «Аптеки 36,6» является соучредителем и членом некоммерческой профессиональной организации Российская ассоциация аптечных сетей (РААС).